所得税的计税对象是所得额，所以一般不宜采用对收入直接予以免税的方式，除非要体现特别的政策取向和扶持。所得税法只规定了国债利息、股息红利、非营利组织收入可以直接作为免税收入，且没有“其他、等”兜底性条款。后来在一些专门文件中，又增加了一些特定收入作为免税收入，如地方债利息、证券投资基金取得收入以及其他一些专项收入，到目前为止免税收入共有10多项。
一、免税收入是对收入的优惠，其免税收入对应的成本费用可在所得税前扣除。如股息红利、国债利息收入对应的借款利息支出等均可税前扣除。这也是所得税免税收入与不征税收入最大区别，也和增值税免税收入对应的进项税额不能抵扣的规则完全不同。
二、免税收入之间叠加享受。免税收入和免税收入之间不存在重复享受和叠加的问题，因为免税收入是针对特定收入制定的，不会交叉存在。同一企业不同收入同时符合免税条件，可同时适用免税条款，如企业既有股息红利收入又有国债利息收入。实务中要注意的是非营利组织的收入免税，不是整个单位的所有收入都可以免税，是有指定的收入范围的，只包括接受捐赠、政府补助、会费收入等，不包括从事营利活动取得的收入。但如果非营利组织取得股息红利、国债利息等收入，也可适用免税条款。
三、免税收入优惠和其他优惠形式叠加。免税收入在计算应纳税所得额前，已作扣减处理，有点类似于税收收入的纳税调减。因此一般不会和其他优惠形式产生叠加。但由于收入的免税，直接影响了所得额的减少，一是可能会引起所得税上的亏损，这种亏损也只能在规定年限内弥补。二是由于收入免税，引起所得额减小，从而会影响适用税率变化，从原本适用25税率转为小微企业适用税率，这种情形如属于叠加，当然可以叠加享受的。三是由于收入免税，引起所得额减小和应纳税额减小，从一定程度上削弱了创投企业投资抵扣所得额、购置设备抵免所得税等政策效应。
四、企业取得的免税收入，基本上是特指从指定部门取得的收入，以及税后分配的投资收益，由于不包括销售、转让等经营性收入，不会产生上游免税下游作成本费用的情况，因此一般也不会产生关联企业间避税空间。但是，本企业收入免税同时，由于免税产生的转让所得的亏损，又如国债利息按票面利率计算免税导致转让形成亏损等，以及通过转让股权同时转让股息红利免税权等问题，都需要引起足够重视。
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