一、通行费发票抵扣进项税额的计算

自2018年1月1日起，纳税人支付的道路、桥、闸通行费，按照以下规定抵扣进项税额：

（一）纳税人支付的道路通行费，按照收费公路通行费增值税电子普通发票上注明的增值税额抵扣进项税额。

2018年1月1日至6月30日，纳税人支付的高速公路通行费，如暂未能取得收费公路通行费增值税电子普通发票，可凭取得的通行费发票（不含财政票据，下同）上注明的收费金额按照下列公式计算可抵扣的进项税额：

高速公路通行费可抵扣进项税额=高速公路通行费发票上注明的金额÷(1+3%)×3%

2018年1月1日至12月31日，纳税人支付的一级、二级公路通行费，如暂未能取得收费公路通行费增值税电子普通发票，可凭取得的通行费发票上注明的收费金额按照下列公式计算可抵扣进项税额：

一级、二级公路通行费可抵扣进项税额=一级、二级公路通行费发票上注明的金额÷(1+5%)×5%

（二）纳税人支付的桥、闸通行费，暂凭取得的通行费发票上注明的收费金额按照下列公式计算可抵扣的进项税额：

桥、闸通行费可抵扣进项税额=桥、闸通行费发票上注明的金额÷(1+5%)×5%

（三）通行费，是指有关单位依法或者依规设立并收取的过路、过桥和过闸费用。

政策依据：财税[2017]90号 财政部 国家税务总局关于租入固定资产进项税额抵扣等增值税政策的通知

二、通行费电子发票的规定

（一）通行费电子发票开具规定

1、通行费电子发票分为以下两种：

（1）左上角标识“通行费”字样，且税率栏次显示适用税率或征收率的通行费电子发票（以下称征税发票）。

（2）左上角无“通行费”字样，且税率栏次显示“不征税”的通行费电子发票（以下称不征税发票）。

2、ETC后付费客户和用户卡客户索取发票的，通过经营性收费公路的部分，在发票服务平台取得由收费公路经营管理单位开具的征税发票；通过政府还贷性收费公路的部分，在发票服务平台取得暂由ETC客户服务机构开具的不征税发票。

3、ETC预付费客户可以自行选择在充值后索取发票或者实际发生通行费用后索取发票。

在充值后索取发票的，在发票服务平台取得由ETC客户服务机构全额开具的不征税发票，实际发生通行费用后，ETC客户服务机构和收费公路经营管理单位均不再向其开具发票。

客户在充值后未索取不征税发票，在实际发生通行费用后索取发票的，通过经营性收费公路的部分，在发票服务平台取得由收费公路经营管理单位开具的征税发票；通过政府还贷性收费公路的部分，在发票服务平台取得暂由ETC客户服务机构开具的不征税发票。

4、未办理ETC卡或用户卡的现金客户，暂按原有方式交纳通行费和索取票据。

5、2018年1月1日以后使用ETC卡或用户卡交纳的通行费，以及ETC卡充值费可以开具通行费电子发票，不再开具纸质票据。

6、客户使用ETC卡或用户卡通行收费公路并交纳通行费的，可以在实际发生通行费用后第10个自然日（遇法定节假日顺延）起，登录发票服务平台，选择相应通行记录取得通行费电子发票；客户可以在充值后实时登录发票服务平台，选择相应充值记录取得通行费电子发票。

（二）通行费发票的勾选确认

增值税一般纳税人取得符合规定的通行费电子发票后，应当自开具之日起360日内登录本省（区、市）增值税发票选择确认平台，查询、选择用于申报抵扣的通行费电子发票信息。

按照有关规定不使用网络办税的特定纳税人，可以持税控设备前往主管国税机关办税服务厅，由税务机关工作人员通过增值税发票选择确认平台（税务局端）为其办理通行费电子发票选择确认。

政策依据：交通运输部 国家税务总局2017年第66号 交通运输部 国家税务总局关于收费公路通行费增值税电子普通发票开具等有关事项的公告

【案例一】甲运输公司（一般纳税人）2018年5月取得货物运输销售额（不含税）合计80万元；购买汽油取得增值税专用发票注明销售额20万元，增值税额3.2万元；修理汽车取得修理费专用发票注明销售额10万元，增值税额1.6万元；取得高速公路通行费发票，注明金额8.24万元；取得一、二级公路通行费发票注明金额2100元。请问甲运输公司5月应纳增值税额是多少？

解析：销项税额=800000×10% = 80000（元）

进项税额=32000+16000+82400÷(1+3%)×3%+2100÷(1+5%)×5%= 50500(元)

应纳税额=80000 - 50500=29500（元）

答：甲运输公司4月应纳增值税额为29500元。

【案例二】公司为车辆办理ETC充值卡，充值时取得的发票能否按照过路过桥费计算抵扣？

乙公司为10辆小轿车统一办理了ETC充值卡，充值时取得的发票能否按照过路过桥费计算抵扣？

答：通行费电子发票分为以下两种：一是左上角标识“通行费”字样，且税率栏次显示适用税率或征收率的通行费电子发票，即征税发票；二是左上角无“通行费”字样，且税率栏次显示“不征税”的通行费电子发票，即不征税发票。根据《财政部 国家税务总局关于租入固定资产进项税额抵扣等增值税政策的通知》（财税[2017]90号）规定，纳税人支付的道路通行费，按照收费公路通行费增值税电子普通发票上注明的增值税额抵扣进项税额。也就是说，由于不征税发票上没有增值税额，不征税发票不得抵扣进项税额。

根据《交通运输部 国家税务总局关于收费公路通行费增值税电子普通发票开具等有关事项的公告》（交通运输部 国家税务总局2017年第66号）规定，ETC预付费客户可以自行选择在充值后索取发票或者实际发生通行费用后索取发票。在充值后索取发票的，在发票服务平台取得由ETC客户服务机构全额开具的不征税发票，实际发生通行费用后，ETC客户服务机构和收费公路经营管理单位均不再向其开具发票。客户在充值后未索取不征税发票，在实际发生通行费用后索取发票的，通过经营性收费公路的部分，在发票服务平台取得由收费公路经营管理单位开具的征税发票；通过政府还贷性收费公路的部分，在发票服务平台取得暂由ETC客户服务机构开具的不征税发票。

综上所述，纳税人在ETC卡充值后取得的发票只能是不征税发票，不得抵扣进项税额。