运费发票备注栏没有填写属于不合规发票，需要退回重开。

政策依据：

国家税务总局公告2015年99号 国家税务总局关于停止使用货物运输业增值税专用发票有关问题的公告：

第一条 增值税一般纳税人提供货物运输服务，使用增值税专用发票和增值税普通发票，开具发票时应将起运地、到达地、车种车号以及运输货物信息等内容填写在发票备注栏中，如内容较多可另附清单。