国家税务总局公告2016年第23号规定：按照现行政策规定，适用差额征税办法缴纳增值税，且不得全额开具增值税发票的（财政部、税务总局另有规定的除外），纳税人自行开具或者税务机关代开增值税发票时，通过新系统中差额征税开票功能，录入含税销售额（或含税评估额）和扣除额，系统自动计算税额和不含税金额，备注栏自动打印“差额征税”字样，发票开具不应与其他应税行为混开。差额征税业务及开票方式参考下图：
业务 | 差额征税销售额 | 税率/征收率 | 开票方式 |
金融商品转让 | 销售额=卖出价-买入价 正负差年内可以相抵，年末负差不得结转。 | 一般纳税人6%税率，小规模纳税人3%征收率 | 全额开具增值税专用发票或普通发票。 提醒： 1、金融商品转让不得开具专用发票。因此只能全额开具普通发票。 2、融资性售后回租按贷款服务交税，受票方不能抵扣进项税额，因此不建议开专用发票。 |
建筑服务 | 销售额=全部价款+价外费用-分包款 | 一般纳税人简易计税、小规模纳税人3%征收率 | |
销售房地产项目 | 销售额=全部价款+价外费用-支付的土地价款 | 一般纳税人一般计税10%税率 | |
转让不动产 | 销售额=全部价款+价外费用-不动产购置原价或者取得不动产时的作价 | 一般纳税人简易计税、小规模纳税人5%征收率 | |
客运场站服务 | 销售额=全部价款+价外费用-支付给承运方的运费 | 一般纳税人6%税率 | |
物业管理服务 | 销售额=收取的自来水水费-对外支付的自来水水费 | 一般纳税简易计税、小规模纳税人3%征收率 | |
航空运输企业 | 销售额=全部价款+价外费用-代收的机场建设费和代售其他航空运输企业客票而代收转付的价款 | 一般纳税人10%税率，小规模纳税人3%征收率 | |
融资租赁服务 | 销售额=全部价款+价外费用-支付的借款利息（包括外汇借款和人民币借款利息）、发行债券利息、车辆购置税 | 有形动产租赁：一般纳税人16%税率、小规模纳税人3%征收率； 不动产租赁：一般纳税人10%税率，小规模纳税人5%征收率 | |
融资性售后回租 | 销售额=全部价款+价外费用（不含本金）-对外支付的借款利息（包括外汇借款和人民币借款利息）、发行债券利息 | 一般纳税人6%税率，小规模纳税人3%征收率 | |
经纪代理服务 | 销售额=全部价款+价外费用-向委托方收取并代为支付的政府性基金或者行政事业性收费 | 一般纳税人6%税率，小规模纳税人3%征收率 | 有两种开票方法： 1、全额开具一张增值税普通发票。 2、开具两张发票： 差额扣除部分开普通发票、余额（扣除后的销售额）开专用发票；并且两张发票的税率相同。 |
劳务派遣、 安全保护 | 销售额=全部价款+价外费用-代为支付给劳务派遣员工的工资、福利和为其办理社会保险及住房公积金 | 一般纳税人简易计税、小规模纳税人5%征收率 （选择全额纳税时，一般纳税人6%税率、小规模纳税人3%征收率） | |
人力资源外包服务 | 销售额=全部价款+价外费用-受客户单位委托代为向客户单位员工发放的工资和代理缴纳的社会保险、住房公积金 注：该业务只能差额征收。 | 一般纳税人6%税率、也可选择简易计税5%征收率；小规模纳税人3% | |
旅游服务 | 销售额=全部价款+价外费用-向客户收取并支付给其他单位或者个人的住宿费、餐饮费、交通费、签证费、门票费和支付给其他接团旅游企业的旅游费用 | 一般纳税人6%税率，小规模纳税人3%征收率 （选择全额纳税时，税率和征收率不变） | |
教育辅助服务 | 销售额=考试费收入-支付给境外单位的考试费 | 一般纳税人6%税率，小规模纳税人3%征收率 | |
签证代理服务 | 签证代理服务销售额=全部价款+价外费用-收取并代为支付给外交部和外国驻华使（领）馆的签证费、认证费； 代理进口按规定免征进口增值税的货物销售额=全部价款+价外费用-向委托方收取并代为支付的货款 | 一般纳税人6%，小规模纳税人3% | |
电信业通过手机短信公益特服号为公益机构接受捐款提供服务 | 销售额=全部价款+价外费用-支付给公益机构的捐款 | 一般纳税人增值电信服务6%；小规模纳税人3% |
常见问题
【常见问题一】建筑业一般纳税人选择简易计税3%缴税，能否开具专用发票
解决方法：建筑业一般纳税人选择简易计税3%缴纳增值税，可以开具增值税专用发票。简易计税项目不能开具增值税专用发票的情形参考税总货便函[2017]127号文件第二章第十一条的规定(本文2.2.1 不得开专票的情况)。
【常见问题二】劳务派遣公司代发的工资能否开专票
解决方法：根据财税[2016]47号文件规定，纳税人（包括一般纳税人和小规模）提供劳务派遣服务，可以以取得的全部价款和价外费用为销售额按照一般计税方法（一般纳税人）/简易计税方法依3%的征收率（小规模）计算缴纳增值税；也可以选择差额纳税，以取得的全部价款和价外费用，扣除代用工单位支付给劳务派遣员工的工资、福利和为其办理社会保险及住房公积金后的余额为销售额，按照简易计税方法依5%的征收率计算缴纳增值税。
选择差额纳税的纳税人，向用工单位收取用于支付给劳务派遣员工工资、福利和为其办理社会保险及住房公积金的费用，不得开具增值税专用发票，可以开具普通发票。
